El padre Luis Fernando Múnera Congote, S.J. es licenciado en Filosofía de la Pontificia Universidad Javeriana; Bachiller en Teología y Doctor en Filosofía del Centro Sèvres de París.  

Fue decano de la Facultad de Ciencias Políticas y Relaciones Internacionales; asesor del vicerrector académico; y codirector del Programa de Planeación Universitaria sobre Paz y Reconciliación, además ejerció como profesor asociado de la Facultad de Filosofía de la Javeriana, donde ocupó el cargo de director de carrera. 

En la Javeriana seccional Cali trabajó en el área de formación social y coordinó la Especialización en Ética y Valores, donde también se desempeñó como profesor de Ética, Política y Filosofía. 

Entre 2001 y 2003, fue director ejecutivo del Programa por la Paz de la Compañía de Jesús en Colombia y ha trabajado en la formación de los jesuitas del país. Hizo parte del Consejo de Regentes de la Javeriana, entre agosto de 2012 y noviembre de 2019.

La Secretaría Privada se encarga de apoyar la gestión del Rector, en todo lo correspondiente a las comunicaciones internas y externas que se recibe o se envían desde el Despacho, tanto para el Gobierno General de la Universidad como las facultades, los estudiantes, las instituciones gubernamentales, y el público en general, permitiendo con ello descargar el flujo operativo del Despacho, para que el Rector pueda destinar sus mejores esfuerzos a la gestión y desarrollo de la Universidad.

Funciones del Secretario Privado

• Responder por la organización y el mantenimiento del archivo del despacho del Rector.
• Coordinar el trámite y hacer seguimiento a la correspondencia y otras comunicaciones personales dirigidas al Rector y a las que él envía.
• Apoyar al Rector en la preparación de sus intervenciones en los distintos eventos a los cuales sea invitado, y de otros documentos.
• Administrar la agenda del Rector y coordinar el desarrollo y seguimiento de las actividades previstas en ella.
• Responder por la distribución de las comunicaciones del Rector y por la publicación de sus documentos.
• Coordinar lo relativo a los viajes que realice el Rector.
• Coordinar y controlar las actividades del personal administrativo adscrito a la Rectoría, coordinar con los superiores inmediatos de dicho personal la evaluación de su desempeño, y procurar su desarrollo y capacitación.
• Coordinar las actividades necesarias para asegurar la dotación de la Rectoría, la administración, el mantenimiento y la conservación de sus instalaciones.
• Coordinar la elaboración del inventario de los activos de la Rectoría y velar por su actualización y conservación.
• Efectuar el seguimiento de la asignación de los activos fijos y coordinar el préstamo de los mismos.
• Coordinar la elaboración del presupuesto de la Rectoría, y suministrar los informes de acuerdo con las disposiciones fijadas al respecto.
• Administrar la caja menor de la Rectoría.
• Las demás que el Rector estime convenientes.

Funciones

Apoyar al Rector en la articulación y el seguimiento, interno y externo, de las organizaciones o espacios donde la Pontificia Universidad Javeriana participa como miembro, y que corresponden a temas estratégicos y transversales de la Universidad en relación con los sectores académico, público y privado.

• Alianza Universidad Empresa Estado
• Asociación Colombiana de Universidades -ASCUN-
• Bogotá Cómo Vamos y Concejo Cómo Vamos
• Connect Bogotá Región
• Foro de Presidentes
• Órgano Colegiado de Administración y Decisión -OCAD- del Fondo de Ciencia, Tecnología e Innovación -CTel-, del Sistema General de Regalías